Baklažány omyjeme, oloupeme na nakrájíme příčně nebo podélně na plátky. Osolíme je, obalíme v hladké mouce a smažíme na oleji.
Do vymazané zapékací mísy dáváme vrstvu baklažánů, vrstvu strouhaného sýru, zředěný rajský protlak. Vrstvy střídáme. Nahoře musí být vrstva baklažánů. Vše zalijeme rozšlehanými vejci. Musaku zapékáme ve vyhřáté troubě při 180 °C dozlatova.
Řeckou musaku z baklažánů ihned podáváme.